现任中国农业科学院协同创新行动“作物营养强化与健康”首席科学家及科技创新工程“作物代谢调控与营养强化”团队首席科学家。农业部农业基因组学重点实验室副主任，农业基因资源与生物技术北京市重点实验室学术委员会副主任。
主持多项国家级课题，包括“973计划”项目、国家“转基因生物新品种培育重大专项”、国家自然科学基金重大研究计划项目、北京市自然科学基金重点项目等以及国际合作项目。近5年在The Plant Cell、Plant Physiology等国际知名学术刊物发表SCI论文20余篇。获国家科学技术进步二等奖1项，全国优秀科普作品奖1项，国家授权专利3项，主编专著1部，参编专著3部。
主要从事植物微量营养素代谢及玉米功能基因组学研究，多次受邀在国际与国内学术会议上做大会报告。关于叶酸代谢与氮代谢相关性的研究填补了国内植物叶酸代谢领域基础理论研究的空白。自2009年起担任中国作物营养强化项目副主任，负责协调组织全国范围内30余家相关科研院所和大专院校的专家组成多学科交叉的研究团队，针对中国人群尤其是贫困人口的微量营养素缺乏问题开展相关研究并取得了重要成果，产生了广泛的社会影响。第535次香山科学会议《满足人体健康需求为导向的农业》申请人/执行主席/报告人，首届亚太国际植物表型组大会组织人。
中国作物营养强化项目（HarvestPlus-China）常务副主任，中国农业生物技术学会常务理事，中国作物学会常务理事，美国植物生理学会会员,中国细胞生物学会会员，中国生物工程学会会员；《中国农业科技导报》执行主编、 《亚热带植物学报》编委、American Journal of Experimental Biology编委。中国科技大学苏州研究院及安徽农业大学生命科学学院客座教授。2015年入选农业部“全国农业科研杰出人才”，“2015全球生物经济峰会”理事会成员。
发表论文：
1、The differential transcription network between embryo and endosperm in the early developing maize seed. 2013.Xiaoduo Lu, Dijun Chen, Defeng Shu, Zhao Zhang, Weixuan Wang, Christian Klukas, Ling-ling Chen, Yunliu Fan, Ming Chen, Chunyi Zhang. Plant Physiology；
2、The mitochondrial folylpolyglutamatesynthetase Gene is required for nitrogen utilization during early seedling development in Arabidopsis. 2013. Ling Jiang, Yanyan Liu, Hong Sun, Yueting Han, Jinglai Li, Changkun Li, WenzhuGuo, HongyanMeng, Sha Li, Yunliu Fan, Chunyi Zhang. Plant Physiology；
3、An Arabidopsis gene encoding a C2H2-domain protein with alternatively spliced transcripts is essential for endosperm development. 2012. Xiaoduo Lu, Yuan Li, Yanping Su, Qiuju Liang, HongyanMeng, Sha Li, Songdong Shen, Yunliu Fan, Chunyi Zhang. Journal of Experimental Botany；
4、Arabidopsis PlastidialFolylpolyglutamateSynthetase Is Required for Seed Reserve Accumulation and Seedling Establishment in Darkness. 2014. Meng H, Jiang L, Xu B, Guo W, Li J, Chunyi Zhang.PLoS One；
5、FtsHi4 Is Essential for Embryogenesis Due to Its Influence on Chloroplast Development in Arabidopsis. 2014. Lu X, Zhang D, Li S, Su Y, Liang Q,Chunyi Zhang. PLoS One；
6、Expressional and regulatory characterization of Arabidopsis RNA-dependent RNA polymerase 1. 2013. Tao Xu, Liang Zhang, Jie Zhen, Yunliu Fan, Chunyi Zhang*, Lei Wang* Planta；
7、Genome-wide identification, classification and expression profiling of nicotianamine synthase (NAS) gene family in maize.2013. Xiaojin Zhou, SuZhen Li, Qianqian Zhao, Xiaoqing Liu, Shaojun Zhang, Cheng Sun, Yunliu Fan, Chunyi Zhang*, Rumei Chen*. BMC Genomics；
8、EMB1211is required for normal embryo development and influences chloroplast biogenesis in Arabidopsis. 2010. Liang Qiuju, Lu Xiaoduo, Jiang Ling, Wang Chongying, Fan Yunliuand Zhang Chunyi. PhysiologiaPlantarum；
9、Preventing protein aggregation by its hyper-acidic fusion cognates in Escherichia coli. 2011. Zou Zhurong, Yunliu Fan, Chunyi Zhang. Protein Expression and Purification；
10、The ArabidopsisMutS homolog AtMSH5 is required for normal meiosis.2008.Xiaoduo Lu, Xiaolin Liu, Lizhe An, Wei Zhang, Jian Sun, Huijuan Pei, HongyanMeng, Yunliu Fan, Chunyi Zhang. Cell Research。