2002年6月毕业于华中农业大学,获农学硕士学位;
2005年6月毕业于中国农业大学,获理学博士学位;
2005年7月-2008年3月,中国农业科学院生物技术研究所博士后;
2009年1月至今,中国农业科学院生物技术研究所副研究员、研究员。
人才团队

研究员
博士生导师
农业微生物学
微生物智能设计与合成
农业微生物技术创新组
微生物学
面向农业高质量发展的国家重大需求,以合成生物技术和微生物组技术为重点方向,开展人工固氮体系智能设计、重要农用功能基因挖掘及育种应用、新型微生物菌剂和功能蛋白产品创制等科研工作。在美国科学院院刊(PNAS, 2008, 2016)等国际知名刊物发表学术论文60多篇。获国家发明专利授权20余项,其中固氮及抗逆元件相关专利实现成果转化。获中国技术市场协会金桥奖二等奖1项、全国颠覆性技术创新大赛优胜奖1项。
担任“农业微生物资源发掘与利用”全国重点实验室副主任,农业农村部农业微生物组学重点实验室副主任,中国农业科学院“农业生物合成”科技攻关行动负责人,“微生物智能设计与合成”创新团队首席科学家,中国农业科学院“青年英才”。
社会兼职:
中国微生物学会理事;中国农业生物技术学会常务理事;北京微生物学会副理事长;农业部肥料登记评审委员会委员;《生物技术进展》编委。
课题情况:
先后主持国家重点研发计划项目、973课题、863课题、国家自然科学基金项目等国家及省部级科研项目20余项。
①国家重点研发计划项目(批准号2024YFA0918200):高效抗逆固氮体系的人工设计与应用示范。时间2024.11-2029.10;项目首席
②国家重点研发计划课题(批准号2019YFA0904702):高效联合固氮体系的智能设计与系统优化。时间2020.1-2024.12;主持
③国家重点基础研究发展计划(973计划)(批准号2010CB126504):联合固氮菌固氮基因网络调控与酶催化分子机理。时间2010.1-2014.8;主持
④国家高技术研究发展计划(863计划) (批准号2010AA10A203):根际固氮微生物功能基因组。时间2010.1-2010.11;主持
⑤国家自然科学基金 (批准号32270067):固氮施氏假单胞菌非优势碳源葡萄糖促进生物膜形成的分子机制。时间2023.1-2026.12;主持
⑥国家自然科学基金 (批准号31770067):施氏假单胞菌铁吸收调节蛋白Fur调控固氮基因表达的分子机制。时间2018.1-2021.12;主持
⑦国家自然科学基金 (批准号31470174):施氏假单胞菌非编码RNA nfiS 参与固氮基因表达调控的分子机制。时间2015.1-2018.12;主持
⑧国家自然科学基金 (批准号31170081):施氏假单胞菌氮代谢基因簇 glnD-map 调节固氮基因表达的分子机理。时间2012.1-2015.12;主持
⑨国家自然科学基金 (批准号30970093):固氮斯氏假单胞菌的氮信号传导与调控网络研究。时间2010.1-2012.12;主持
⑩国家自然科学基金(批准号30800022):斯氏假单胞菌“固氮岛”的水平转移与固氮特性分析。时间2009.1-2011.12;主持
主要专利:
①国家发明专利:一种贝莱斯芽孢杆菌及其应用。授权号:ZL202410159731 .4。第一发明人
②国家发明专利:一种甲基转移酶在增强固氮微生物的固氮能力方面的用途和方法。授权号:ZL202410210373.5。第一发明人
③国家发明专利: rsmA 基因在植物根表定殖和促生方面的应用。授权号:ZL201310593220.5。第一发明人
④国家发明专利:一种抗氧化及耐高盐胁迫的人工合成sRNA及其用途。申请号:ZL201510007581.6。第一发明人
⑤国家发明专利:一种维持菌株高效固氮能力的基因。授权号:ZL201510296702.3。第一发明人
⑥国家发明专利:特异响应逆境信号的 nfiS 基因的用途及其使用方法。授权号:ZL201410262604.3。第一发明人
发表论文:
1) Yan Y#, Yang J#, Dou Y, Chen M, Ping S, Peng J, Lu W, Zhang W, Yao Z, Li H, Liu W, He S, Geng L, Zhang X, Yang F, Yu H, Zhan Y, Li D, Lin Z, Wang Y, Elmerich C, Lin M*, Jin Q*. Nitrogen fixation island and rhizosphere competence traits in the genome of the root-associated Pseudomonas stutzeri A1501. PNAS. 2008,105 (21): 7564-7569
2) Zhan Y#, Yan Y#, Deng Z, Chen M, Lu W, Lu C, Shang L, Yang Z, Zhang W, Wang W, Li Y, Ke Q, Lu J, Xu Y, Zhang L, Xie Z, Cheng Q, Elmerich C, Lin M*. The novel regulatory ncRNA, NfiS, optimizes nitrogen fixation via base pairing with the nitrogenase gene nifK mRNA in Pseudomonas stutzeri A1501. PNAS. 2016,113(30), E4348-4356
3) Lv F, Zhan Y, Feng H, Sun W, Yin C, Han Y, Shao Y, Xue W, Jiang S, Ma Y, Hu H, Wei J, Yan Y*, Lin M*. Integrated Hfq-interacting RNAome and transcriptomic analysis reveals complex regulatory networks of nitrogen fixation in root-associated Pseudomonas stutzeri A1501. mSphere. 2024; 9(6):e0076223.
4)Liguo Shang#, Yongliang Yan#, Yuhua Zhan, Xiubin Ke, Yahui Shao, Yaqun Liu, Hua Yang, Shanshan Wang, Shuling Dai, Jiasi Lu, Ning Yan, Zhimin Yang, Wei Lu, Zhu Liu, Shanchun Chen, Claudine Elmerich, Min Lin. A regulatory network involving Rpo, Gac and Rsm for nitrogen-fixing biofilm formation by Pseudomonas stutzeri. npj Biofilms and Microbiomes. 2021, 7(1):54.
5) Lv F, Zhan Y, Lu W, Ke X, Shao Y, Ma Y, Zheng J, Yang Z, Jiang S, Shang L, Ma Y, Cheng L, Elmerich C, Yan Y*, Lin M*. Regulation of hierarchical carbon substrate utilization, nitrogen fixation, and root colonization by the Hfq/Crc/CrcZY genes in Pseudomonas stutzeri .iScience. 2022; 25(12):105663.
6) Yan Y#, Ping S#, Peng J, Han Y, Li L, Yang J, Dou Y, Li Y, Fan H, Fan Y, Li D, Zhan Y, Chen M, Lu W, Zhang W, Cheng Q, Jin Q, Lin M*. Global transcriptional analysis of nitrogen fixation and ammonium repression in root-associated Pseudomonas stutzeri A1501. BMC genomics. 2010, 11:11
7) Li D#, Yan Y#, Ping S, Chen M, Zhang W, Li L, Lin W, Geng L, Liu W, Lu W, Lin M*. Genome-wide investigation and functional characterization of the beta-ketoadipate pathway in the nitrogen-fixing and root-associated bacterium Pseudomonas stutzeri A1501. BMC Microbiol. 2010, 10:36
8) Yu H, M Yuan, W Lu, J Yang, S Dai, Q Li, Z Yang, J Dong, L Sun, Z Deng, W. Zhang, M Chen, S Ping, Y Han, Y Zhan, Yan Y*, Q Jin*, and M. Lin*. Complete genome sequence of the nitrogen-fixing and rhizosphere-associated bacterium Pseudomonas stutzeri strain DSM4166. J Bacteriol. 2011. 193:3422-3.
9) Yuhua Zhan, Zhiping Deng, Yongliang Yan, Hongyang Zhang, Chao Lu, Zhimin Yang, Liguo Shang, Yi Huang, Fanyang Lv, Yaqun Liu, Yichao Liu, Shanshan Wang, Sanfeng Chen, Xue-Xian Zhang, Qi Cheng*, Min Lin*. NfiR, a new regulatory noncoding RNA (ncRNA), is required in concert with the NfiS ncRNA for optimal expression of nitrogenase genes in Pseudomonas stutzeri A1501.Applied and Environmental Microbiology. 2019, 85(14): e00762-19
10) Hongyang Zhang, Yuhua Zhan, Yongliang Yan, Yichao Liu, Guihua Hu, Shanshan Wang, Hua Yang, Xuemeng Qiu, Yaqun Liu, Jiang Li, Wei Lu, Claudine Elmerich, Min Lin*.The Pseudomonas stutzeri-specific regulatory ncRNA, NfiS, targets the katB mRNA encoding a catalase essential for optimal oxidative resistance and nitrogenase activity. Journal of Bacteriology. 2019,201(19):1-16