中国农业生物技术学会成立于1991年4月，现挂靠在中国农业科学院生物技术研究所，为全国性一级学会，由农业农村部科技教育司主管,下设作物生物技术分会、动物生物技术分会、微生物生物技术分会、植物脱毒快繁技术分会、生物安全分会、植物表型组学分会和农业合成生物学七个分会，设有青年工作委员会、科普工作委员会、咨询工作委员会和产业化工作委员会四个工作委员会。现任理事长为万建民院士，副理事长为邓子新、张涌、李新海、程备久、高彩霞、田冰川、宋维平、林敏，秘书长为谷晓峰。

学会的宗旨是促进农业生物技术学科的繁荣和发展，业务范围包括：开展农业生物技术研究和学术交流；承担相关科技项目论证、综合评估和有关政策法规的研究和制订；开展科技咨询服务，推动农业生物技术科学知识普及和成果应用；组织及协调民间国际科技交流与合作活动；参与编辑《农业生物技术学报》杂志及有关学术著作。